Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LRRIQ1Q96JM4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
LRRIQ1Q96JM4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
LRRIQ1Q96JM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LRRIQ1Q96JM4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
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