Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VSIG2Q96IQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VSIG2Q96IQ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG2Q96IQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG2Q96IQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms