Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.938e-7■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-14■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-14■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-14■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 30
FUBP3Q96I24 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-12■■■■■ 29.9
FUBP3Q96I24 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 37.1□□□□□ -1.271e-12■■■■■ 29.9
FUBP3Q96I24 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-12■■■■■ 29.9
FUBP3Q96I24 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.641e-12■■■■■ 29.9
FUBP3Q96I24 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.048e-24■■■■■ 29.9
FUBP3Q96I24 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 SLTM-222ENST00000560494 674 ntTSL 313.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 SLTM-203ENST00000432750 2383 ntTSL 512.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 SLTM-209ENST00000493062 987 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 27.87□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 29.8
FUBP3Q96I24 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.746e-9■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-9■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.876e-9■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 CCL20-203ENST00000473642 680 ntTSL 26.9□□□□□ -1.33e-15■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-12■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 29.7
FUBP3Q96I24 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 SLC44A1-205ENST00000470972 10433 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 SLC44A1-204ENST00000436716 576 ntTSL 57.37□□□□□ -1.234e-8■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 36.9□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-16■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 C12orf49-203ENST00000547630 1371 ntTSL 1 (best)21.88■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AQR-202ENST00000543879 5722 ntTSL 27.72□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 AQR-204ENST00000559090 3637 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 29.3
FUBP3Q96I24 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 NUP58-210ENST00000477876 560 ntTSL 55.99□□□□□ -1.454e-10■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-12■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 29.1
FUBP3Q96I24 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 29
FUBP3Q96I24 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 29
FUBP3Q96I24 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 29
FUBP3Q96I24 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.87□□□□□ -1.792e-12■■■■■ 29
FUBP3Q96I24 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.474e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 313.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 512.67□□□□□ -0.383e-11■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 134.4 ms