RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512749.5

SCOC-209, Transcript of short coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene SCOC, Length 841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOC-209ENST00000512749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.94■■■□□ 2.54
SCOC-209ENST00000512749 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SCOC-209ENST00000512749 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.6■■■□□ 2.01
SCOC-209ENST00000512749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.49■■□□□ 1.99
SCOC-209ENST00000512749 ABCC9O60706 1549 aa27.16■■□□□ 1.94
SCOC-209ENST00000512749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.99■■□□□ 1.75
SCOC-209ENST00000512749 NACADO15069 1562 aa25.95■■□□□ 1.74
SCOC-209ENST00000512749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.91■■□□□ 1.74
SCOC-209ENST00000512749 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.78■■□□□ 1.72
SCOC-209ENST00000512749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SCOC-209ENST00000512749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.59■■□□□ 1.69
SCOC-209ENST00000512749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SCOC-209ENST00000512749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.36■■□□□ 1.65
SCOC-209ENST00000512749 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.29■■□□□ 1.64
SCOC-209ENST00000512749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.24■■□□□ 1.63
SCOC-209ENST00000512749 SCRIBQ14160 1630 aa25.08■■□□□ 1.6
SCOC-209ENST00000512749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.95■■□□□ 1.58
SCOC-209ENST00000512749 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SCOC-209ENST00000512749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SCOC-209ENST00000512749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.53■■□□□ 1.52
SCOC-209ENST00000512749 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SCOC-209ENST00000512749 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.42■■□□□ 1.5
SCOC-209ENST00000512749 NCAPD3P42695 1498 aa24.02■■□□□ 1.44
SCOC-209ENST00000512749 SMARCA4P51532 1647 aa23.99■■□□□ 1.43
SCOC-209ENST00000512749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.99■■□□□ 1.43
SCOC-209ENST00000512749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SCOC-209ENST00000512749 SMARCA2P51531 1590 aa23.86■■□□□ 1.41
SCOC-209ENST00000512749 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.85■■□□□ 1.41
SCOC-209ENST00000512749 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.81■■□□□ 1.4
SCOC-209ENST00000512749 HMGXB3Q12766 1538 aa23.8■■□□□ 1.4
SCOC-209ENST00000512749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SCOC-209ENST00000512749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SCOC-209ENST00000512749 WIZO95785 1651 aa23.54■■□□□ 1.36
SCOC-209ENST00000512749 NESP48681 1621 aa23.47■■□□□ 1.35
SCOC-209ENST00000512749 ERCC6Q03468 1493 aa23.36■■□□□ 1.33
SCOC-209ENST00000512749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.32■■□□□ 1.32
SCOC-209ENST00000512749 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.29■■□□□ 1.32
SCOC-209ENST00000512749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SCOC-209ENST00000512749 CUX2O14529 1486 aa23.23■■□□□ 1.31
SCOC-209ENST00000512749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
SCOC-209ENST00000512749 FOXD1Q16676 465 aa23.13■■□□□ 1.29
SCOC-209ENST00000512749 CFTRP13569 1480 aa23.11■■□□□ 1.29
SCOC-209ENST00000512749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SCOC-209ENST00000512749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.08■■□□□ 1.29
SCOC-209ENST00000512749 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.06■■□□□ 1.28
SCOC-209ENST00000512749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.98■■□□□ 1.27
SCOC-209ENST00000512749 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.97■■□□□ 1.27
SCOC-209ENST00000512749 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.94■■□□□ 1.26
SCOC-209ENST00000512749 WDR62O43379 1518 aa22.9■■□□□ 1.26
SCOC-209ENST00000512749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.83■■□□□ 1.25
SCOC-209ENST00000512749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SCOC-209ENST00000512749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SCOC-209ENST00000512749 PRDM2Q13029 1718 aa22.74■■□□□ 1.23
SCOC-209ENST00000512749 TOPBP1Q92547 1522 aa22.6■■□□□ 1.21
SCOC-209ENST00000512749 ABCC8Q09428 1581 aa22.57■■□□□ 1.2
SCOC-209ENST00000512749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.52■■□□□ 1.2
SCOC-209ENST00000512749 IFT140Q96RY7 1462 aa22.49■■□□□ 1.19
SCOC-209ENST00000512749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SCOC-209ENST00000512749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SCOC-209ENST00000512749 CUX1P39880 1505 aa22.37■■□□□ 1.17
SCOC-209ENST00000512749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SCOC-209ENST00000512749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.33■■□□□ 1.16
SCOC-209ENST00000512749 SOGA1O94964 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
SCOC-209ENST00000512749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SCOC-209ENST00000512749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.3■■□□□ 1.16
SCOC-209ENST00000512749 OSCARQ8IYS5 282 aa22.28■■□□□ 1.16
SCOC-209ENST00000512749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SCOC-209ENST00000512749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SCOC-209ENST00000512749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
SCOC-209ENST00000512749 WDR97A6NE52 1622 aa22.13■■□□□ 1.13
SCOC-209ENST00000512749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.1■■□□□ 1.13
SCOC-209ENST00000512749 TOP2BQ02880 1626 aa22.09■■□□□ 1.13
SCOC-209ENST00000512749 SYNJ1O43426 1573 aa22.08■■□□□ 1.13
SCOC-209ENST00000512749 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.08■■□□□ 1.13
SCOC-209ENST00000512749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.07■■□□□ 1.12
SCOC-209ENST00000512749 GRIN2BQ13224 1484 aa22.06■■□□□ 1.12
SCOC-209ENST00000512749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.04■■□□□ 1.12
SCOC-209ENST00000512749 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.03■■□□□ 1.12
SCOC-209ENST00000512749 FBLN2P98095 1184 aa22.02■■□□□ 1.12
SCOC-209ENST00000512749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SCOC-209ENST00000512749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.98■■□□□ 1.11
SCOC-209ENST00000512749 CHD1O14646 1710 aa21.98■■□□□ 1.11
SCOC-209ENST00000512749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SCOC-209ENST00000512749 SYNJ2O15056 1496 aa21.93■■□□□ 1.1
SCOC-209ENST00000512749 TRIM41Q8WV44 630 aa21.91■■□□□ 1.1
SCOC-209ENST00000512749 PBRM1Q86U86 1689 aa21.9■■□□□ 1.1
SCOC-209ENST00000512749 ARHGEF11O15085 1522 aa21.87■■□□□ 1.09
SCOC-209ENST00000512749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
SCOC-209ENST00000512749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
SCOC-209ENST00000512749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
SCOC-209ENST00000512749 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.83■■□□□ 1.09
SCOC-209ENST00000512749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
SCOC-209ENST00000512749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.79■■□□□ 1.08
SCOC-209ENST00000512749 ADAMTS12P58397 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
SCOC-209ENST00000512749 GRIN2AQ12879 1464 aa21.77■■□□□ 1.07
SCOC-209ENST00000512749 MSH5O43196 834 aa21.73■■□□□ 1.07
SCOC-209ENST00000512749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.73■■□□□ 1.07
SCOC-209ENST00000512749 IGF1RP08069 1367 aa21.72■■□□□ 1.07
SCOC-209ENST00000512749 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
SCOC-209ENST00000512749 ARAP1Q96P48 1450 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.2 ms