Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUB2Q96DC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUB2Q96DC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTUB2Q96DC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTUB2Q96DC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms