Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF18Q96CE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM4SF18Q96CE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF18Q96CE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TM4SF18Q96CE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM4SF18Q96CE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms