Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM239Q8WW34 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM239Q8WW34 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM239Q8WW34 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms