Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COG1Q8WTW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG1Q8WTW3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG1Q8WTW3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG1Q8WTW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG1Q8WTW3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms