Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM20Q8N5G0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM20Q8N5G0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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