Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APLFQ8IW19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APLFQ8IW19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APLFQ8IW19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APLFQ8IW19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms