Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
FGD6Q6ZV73 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FGD6Q6ZV73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FGD6Q6ZV73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FGD6Q6ZV73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
FGD6Q6ZV73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FGD6Q6ZV73 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FGD6Q6ZV73 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms