Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR88Q6ZMY6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR88Q6ZMY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR88Q6ZMY6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR88Q6ZMY6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR88Q6ZMY6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms