Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB11FIP1Q6WKZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB11FIP1Q6WKZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms