Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRGCQ6NXR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRGCQ6NXR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRGCQ6NXR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRGCQ6NXR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRGCQ6NXR0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1437 ms