Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF17Q5VTA0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF17Q5VTA0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF17Q5VTA0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF17Q5VTA0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms