Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PERM1Q5SV97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PERM1Q5SV97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PERM1Q5SV97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PERM1Q5SV97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms