Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LACTB2Q53H82 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LACTB2Q53H82 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LACTB2Q53H82 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LACTB2Q53H82 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LACTB2Q53H82 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LACTB2Q53H82 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms