Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP25-1Q3LHN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP25-1Q3LHN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP25-1Q3LHN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms