Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NBPF8Q3BBV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NBPF8Q3BBV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NBPF8Q3BBV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
NBPF8Q3BBV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NBPF8Q3BBV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms