Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF2Q1L5Z9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF2Q1L5Z9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LONRF2Q1L5Z9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LONRF2Q1L5Z9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF2Q1L5Z9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms