Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ITSN1Q15811 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ITSN1Q15811 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ITSN1Q15811 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ITSN1Q15811 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ITSN1Q15811 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ITSN1Q15811 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
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