Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHAF1AQ13111 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHAF1AQ13111 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1AQ13111 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHAF1AQ13111 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
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