Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH2Q12809 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH2Q12809 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNH2Q12809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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KCNH2Q12809 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNH2Q12809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNH2Q12809 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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