Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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KCNMA1Q12791 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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KCNMA1Q12791 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNMA1Q12791 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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KCNMA1Q12791 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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KCNMA1Q12791 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMA1Q12791 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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KCNMA1Q12791 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMA1Q12791 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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KCNMA1Q12791 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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KCNMA1Q12791 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
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KCNMA1Q12791 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMA1Q12791 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMA1Q12791 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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KCNMA1Q12791 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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KCNMA1Q12791 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMA1Q12791 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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