Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GABPAQ06546 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GABPAQ06546 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
GABPAQ06546 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GABPAQ06546 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GABPAQ06546 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABPAQ06546 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms