Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLE4Q04727 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLE4Q04727 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLE4Q04727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLE4Q04727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE4Q04727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 638.7 ms