Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX5Q02548 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX5Q02548 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX5Q02548 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX5Q02548 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX5Q02548 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX5Q02548 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX5Q02548 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX5Q02548 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAX5Q02548 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAX5Q02548 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX5Q02548 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PAX5Q02548 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX5Q02548 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX5Q02548 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX5Q02548 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX5Q02548 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX5Q02548 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX5Q02548 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms