Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM3P62310 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM3P62310 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM3P62310 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM3P62310 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM3P62310 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM3P62310 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM3P62310 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM3P62310 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM3P62310 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM3P62310 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM3P62310 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM3P62310 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM3P62310 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM3P62310 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM3P62310 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM3P62310 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM3P62310 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM3P62310 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM3P62310 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM3P62310 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM3P62310 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM3P62310 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM3P62310 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM3P62310 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM3P62310 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM3P62310 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM3P62310 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM3P62310 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM3P62310 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM3P62310 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM3P62310 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM3P62310 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM3P62310 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSM3P62310 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM3P62310 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM3P62310 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM3P62310 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM3P62310 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM3P62310 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM3P62310 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSM3P62310 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM3P62310 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM3P62310 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM3P62310 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSM3P62310 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSM3P62310 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM3P62310 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM3P62310 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM3P62310 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM3P62310 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM3P62310 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM3P62310 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM3P62310 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM3P62310 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM3P62310 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM3P62310 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM3P62310 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms