Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP54P61011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP54P61011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP54P61011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP54P61011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP54P61011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP54P61011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP54P61011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP54P61011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP54P61011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP54P61011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP54P61011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP54P61011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP54P61011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP54P61011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP54P61011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP54P61011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP54P61011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP54P61011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP54P61011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP54P61011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP54P61011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP54P61011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP54P61011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP54P61011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP54P61011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP54P61011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP54P61011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP54P61011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP54P61011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP54P61011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP54P61011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP54P61011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP54P61011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP54P61011 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP54P61011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP54P61011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP54P61011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP54P61011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP54P61011 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP54P61011 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP54P61011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP54P61011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP54P61011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP54P61011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP54P61011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP54P61011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP54P61011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP54P61011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRP54P61011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP54P61011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP54P61011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP54P61011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP54P61011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRP54P61011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP54P61011 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP54P61011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP54P61011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP54P61011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRP54P61011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRP54P61011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP54P61011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP54P61011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRP54P61011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP54P61011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRP54P61011 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP54P61011 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP54P61011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRP54P61011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SRP54P61011 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRP54P61011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRP54P61011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms