Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCPP55072 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCPP55072 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCPP55072 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCPP55072 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCPP55072 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCPP55072 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCPP55072 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCPP55072 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCPP55072 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCPP55072 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCPP55072 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCPP55072 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VCPP55072 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCPP55072 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCPP55072 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCPP55072 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCPP55072 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCPP55072 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCPP55072 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCPP55072 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCPP55072 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCPP55072 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCPP55072 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCPP55072 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VCPP55072 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCPP55072 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VCPP55072 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCPP55072 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCPP55072 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCPP55072 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCPP55072 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCPP55072 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCPP55072 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCPP55072 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCPP55072 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCPP55072 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCPP55072 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCPP55072 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VCPP55072 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCPP55072 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VCPP55072 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCPP55072 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCPP55072 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCPP55072 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCPP55072 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VCPP55072 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VCPP55072 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCPP55072 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCPP55072 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCPP55072 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCPP55072 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VCPP55072 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCPP55072 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCPP55072 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCPP55072 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCPP55072 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCPP55072 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCPP55072 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCPP55072 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VCPP55072 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCPP55072 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VCPP55072 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCPP55072 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCPP55072 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCPP55072 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCPP55072 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCPP55072 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCPP55072 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCPP55072 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCPP55072 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms