Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
YARSP54577 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
YARSP54577 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
YARSP54577 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
YARSP54577 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
YARSP54577 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YARSP54577 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YARSP54577 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YARSP54577 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
YARSP54577 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YARSP54577 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YARSP54577 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YARSP54577 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YARSP54577 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YARSP54577 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YARSP54577 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YARSP54577 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YARSP54577 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YARSP54577 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YARSP54577 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
YARSP54577 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YARSP54577 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YARSP54577 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YARSP54577 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YARSP54577 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YARSP54577 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YARSP54577 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YARSP54577 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YARSP54577 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YARSP54577 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YARSP54577 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YARSP54577 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YARSP54577 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YARSP54577 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YARSP54577 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YARSP54577 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YARSP54577 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YARSP54577 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YARSP54577 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YARSP54577 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YARSP54577 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YARSP54577 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YARSP54577 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YARSP54577 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YARSP54577 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YARSP54577 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YARSP54577 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YARSP54577 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YARSP54577 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YARSP54577 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YARSP54577 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YARSP54577 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YARSP54577 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
YARSP54577 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
YARSP54577 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
YARSP54577 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YARSP54577 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YARSP54577 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
YARSP54577 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
YARSP54577 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
YARSP54577 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YARSP54577 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YARSP54577 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
YARSP54577 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YARSP54577 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YARSP54577 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
YARSP54577 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YARSP54577 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
YARSP54577 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
YARSP54577 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YARSP54577 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YARSP54577 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
YARSP54577 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YARSP54577 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
YARSP54577 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
YARSP54577 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YARSP54577 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YARSP54577 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
YARSP54577 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YARSP54577 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YARSP54577 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
YARSP54577 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
YARSP54577 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YARSP54577 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YARSP54577 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
YARSP54577 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YARSP54577 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
YARSP54577 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
YARSP54577 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms