Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFF1P51825 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFF1P51825 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFF1P51825 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFF1P51825 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFF1P51825 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFF1P51825 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFF1P51825 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFF1P51825 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFF1P51825 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFF1P51825 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFF1P51825 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFF1P51825 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFF1P51825 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFF1P51825 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFF1P51825 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFF1P51825 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFF1P51825 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFF1P51825 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFF1P51825 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFF1P51825 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFF1P51825 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFF1P51825 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFF1P51825 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFF1P51825 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFF1P51825 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFF1P51825 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFF1P51825 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
AFF1P51825 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFF1P51825 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFF1P51825 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFF1P51825 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFF1P51825 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFF1P51825 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFF1P51825 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFF1P51825 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFF1P51825 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFF1P51825 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFF1P51825 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFF1P51825 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFF1P51825 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFF1P51825 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFF1P51825 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AFF1P51825 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFF1P51825 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AFF1P51825 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFF1P51825 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFF1P51825 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFF1P51825 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFF1P51825 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFF1P51825 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFF1P51825 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AFF1P51825 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFF1P51825 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFF1P51825 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFF1P51825 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFF1P51825 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFF1P51825 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFF1P51825 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFF1P51825 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFF1P51825 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AFF1P51825 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFF1P51825 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFF1P51825 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFF1P51825 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AFF1P51825 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms