Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC11A2P49281 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC11A2P49281 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC11A2P49281 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC11A2P49281 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC11A2P49281 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.7 ms