Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSSP48449 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSSP48449 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSSP48449 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSSP48449 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSSP48449 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSSP48449 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LSSP48449 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSSP48449 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSSP48449 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSSP48449 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSSP48449 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSSP48449 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSSP48449 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSSP48449 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSSP48449 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LSSP48449 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSSP48449 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSSP48449 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSSP48449 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSSP48449 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSSP48449 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSSP48449 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSSP48449 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LSSP48449 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSSP48449 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSSP48449 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSSP48449 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSSP48449 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSSP48449 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSSP48449 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSSP48449 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSSP48449 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSSP48449 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSSP48449 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSSP48449 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSSP48449 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSSP48449 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSSP48449 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSSP48449 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSSP48449 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSSP48449 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSSP48449 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSSP48449 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSSP48449 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LSSP48449 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSSP48449 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSSP48449 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSSP48449 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSSP48449 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSSP48449 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSSP48449 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSSP48449 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSSP48449 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSSP48449 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSSP48449 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSSP48449 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSSP48449 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSSP48449 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSSP48449 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSSP48449 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSSP48449 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSSP48449 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSSP48449 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSSP48449 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSSP48449 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSSP48449 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSSP48449 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSSP48449 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSSP48449 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSSP48449 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSSP48449 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSSP48449 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LSSP48449 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSSP48449 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms