Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A2P43354 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A2P43354 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A2P43354 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms