Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD52P43351 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD52P43351 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD52P43351 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD52P43351 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD52P43351 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD52P43351 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD52P43351 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD52P43351 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD52P43351 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD52P43351 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD52P43351 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD52P43351 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD52P43351 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD52P43351 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD52P43351 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD52P43351 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD52P43351 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD52P43351 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD52P43351 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD52P43351 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD52P43351 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD52P43351 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD52P43351 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD52P43351 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD52P43351 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD52P43351 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD52P43351 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD52P43351 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD52P43351 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD52P43351 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD52P43351 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD52P43351 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD52P43351 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD52P43351 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD52P43351 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD52P43351 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD52P43351 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD52P43351 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD52P43351 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD52P43351 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD52P43351 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD52P43351 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD52P43351 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD52P43351 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD52P43351 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD52P43351 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD52P43351 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD52P43351 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD52P43351 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD52P43351 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD52P43351 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD52P43351 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD52P43351 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD52P43351 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms