Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA4P41247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA4P41247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA4P41247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA4P41247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PNPLA4P41247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA4P41247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA4P41247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA4P41247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA4P41247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNPLA4P41247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNPLA4P41247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNPLA4P41247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PNPLA4P41247 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA4P41247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA4P41247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA4P41247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA4P41247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA4P41247 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA4P41247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNPLA4P41247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA4P41247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA4P41247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms