Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
KDM5CP41229 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
KDM5CP41229 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5CP41229 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5CP41229 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5CP41229 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
KDM5CP41229 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5CP41229 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms