Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ETV3P41162 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ETV3P41162 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ETV3P41162 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ETV3P41162 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ETV3P41162 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ETV3P41162 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ETV3P41162 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ETV3P41162 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ETV3P41162 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ETV3P41162 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ETV3P41162 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ETV3P41162 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ETV3P41162 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ETV3P41162 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ETV3P41162 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ETV3P41162 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ETV3P41162 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ETV3P41162 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ETV3P41162 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ETV3P41162 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ETV3P41162 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ETV3P41162 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ETV3P41162 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ETV3P41162 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ETV3P41162 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ETV3P41162 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ETV3P41162 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ETV3P41162 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ETV3P41162 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ETV3P41162 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ETV3P41162 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ETV3P41162 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ETV3P41162 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ETV3P41162 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ETV3P41162 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ETV3P41162 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ETV3P41162 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ETV3P41162 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ETV3P41162 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ETV3P41162 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ETV3P41162 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ETV3P41162 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ETV3P41162 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ETV3P41162 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ETV3P41162 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ETV3P41162 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ETV3P41162 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ETV3P41162 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ETV3P41162 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ETV3P41162 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ETV3P41162 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ETV3P41162 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ETV3P41162 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ETV3P41162 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ETV3P41162 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ETV3P41162 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ETV3P41162 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms