Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAR1BP31321 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKAR1BP31321 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAR1BP31321 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAR1BP31321 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAR1BP31321 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms