Protein–RNA interactions for Protein: P31040

SDHA, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAP31040 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAP31040 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAP31040 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAP31040 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAP31040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAP31040 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAP31040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAP31040 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAP31040 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAP31040 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAP31040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAP31040 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAP31040 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAP31040 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAP31040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAP31040 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAP31040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAP31040 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAP31040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAP31040 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAP31040 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAP31040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAP31040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAP31040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAP31040 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAP31040 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAP31040 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAP31040 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAP31040 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAP31040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAP31040 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAP31040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAP31040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAP31040 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAP31040 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAP31040 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAP31040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAP31040 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAP31040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAP31040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAP31040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAP31040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAP31040 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAP31040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAP31040 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAP31040 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAP31040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAP31040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAP31040 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAP31040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAP31040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAP31040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAP31040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAP31040 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAP31040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAP31040 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAP31040 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAP31040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAP31040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAP31040 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAP31040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms