Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMOD1P29536 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMOD1P29536 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LMOD1P29536 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMOD1P29536 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms