Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARNTP27540 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARNTP27540 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARNTP27540 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARNTP27540 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARNTP27540 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARNTP27540 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARNTP27540 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARNTP27540 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARNTP27540 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARNTP27540 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARNTP27540 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARNTP27540 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARNTP27540 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARNTP27540 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARNTP27540 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARNTP27540 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARNTP27540 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARNTP27540 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARNTP27540 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARNTP27540 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARNTP27540 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARNTP27540 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARNTP27540 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARNTP27540 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARNTP27540 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARNTP27540 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARNTP27540 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARNTP27540 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARNTP27540 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARNTP27540 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARNTP27540 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARNTP27540 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARNTP27540 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARNTP27540 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARNTP27540 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARNTP27540 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARNTP27540 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARNTP27540 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARNTP27540 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARNTP27540 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARNTP27540 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARNTP27540 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARNTP27540 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARNTP27540 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARNTP27540 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARNTP27540 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARNTP27540 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARNTP27540 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARNTP27540 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARNTP27540 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARNTP27540 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARNTP27540 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARNTP27540 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARNTP27540 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARNTP27540 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARNTP27540 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARNTP27540 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARNTP27540 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARNTP27540 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARNTP27540 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARNTP27540 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARNTP27540 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTP27540 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARNTP27540 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARNTP27540 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTP27540 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARNTP27540 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms