Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP100P23497 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP100P23497 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP100P23497 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP100P23497 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP100P23497 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP100P23497 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP100P23497 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP100P23497 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP100P23497 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP100P23497 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP100P23497 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP100P23497 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP100P23497 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP100P23497 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP100P23497 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SP100P23497 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP100P23497 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SP100P23497 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP100P23497 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP100P23497 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP100P23497 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SP100P23497 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP100P23497 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP100P23497 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP100P23497 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP100P23497 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP100P23497 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP100P23497 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP100P23497 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP100P23497 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP100P23497 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP100P23497 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP100P23497 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP100P23497 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP100P23497 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP100P23497 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP100P23497 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP100P23497 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP100P23497 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP100P23497 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP100P23497 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP100P23497 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP100P23497 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP100P23497 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP100P23497 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP100P23497 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SP100P23497 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP100P23497 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP100P23497 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP100P23497 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP100P23497 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP100P23497 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP100P23497 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP100P23497 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP100P23497 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP100P23497 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP100P23497 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP100P23497 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP100P23497 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP100P23497 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SP100P23497 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP100P23497 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SP100P23497 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP100P23497 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP100P23497 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP100P23497 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP100P23497 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP100P23497 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP100P23497 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP100P23497 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SP100P23497 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP100P23497 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP100P23497 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP100P23497 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP100P23497 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP100P23497 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP100P23497 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SP100P23497 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP100P23497 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP100P23497 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP100P23497 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP100P23497 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms