Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGA4P13612 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA4P13612 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA4P13612 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA4P13612 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGA4P13612 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms