Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALM3P0DP25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CALM3P0DP25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALM3P0DP25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALM3P0DP25 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms