Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3P09919 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3P09919 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3P09919 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3P09919 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF3P09919 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF3P09919 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF3P09919 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3P09919 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF3P09919 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3P09919 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3P09919 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3P09919 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3P09919 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3P09919 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3P09919 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3P09919 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3P09919 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3P09919 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3P09919 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3P09919 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3P09919 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3P09919 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3P09919 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3P09919 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3P09919 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3P09919 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3P09919 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3P09919 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3P09919 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3P09919 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3P09919 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3P09919 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3P09919 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3P09919 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3P09919 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3P09919 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3P09919 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3P09919 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3P09919 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3P09919 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3P09919 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3P09919 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3P09919 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3P09919 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3P09919 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3P09919 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3P09919 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3P09919 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3P09919 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3P09919 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3P09919 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3P09919 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3P09919 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3P09919 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3P09919 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3P09919 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3P09919 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3P09919 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms