Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPARCP09486 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPARCP09486 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPARCP09486 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPARCP09486 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPARCP09486 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPARCP09486 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPARCP09486 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPARCP09486 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPARCP09486 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPARCP09486 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPARCP09486 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPARCP09486 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPARCP09486 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPARCP09486 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPARCP09486 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPARCP09486 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPARCP09486 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPARCP09486 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPARCP09486 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPARCP09486 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPARCP09486 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPARCP09486 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPARCP09486 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPARCP09486 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPARCP09486 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPARCP09486 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPARCP09486 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPARCP09486 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPARCP09486 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPARCP09486 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPARCP09486 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPARCP09486 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPARCP09486 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPARCP09486 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPARCP09486 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPARCP09486 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPARCP09486 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPARCP09486 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPARCP09486 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPARCP09486 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPARCP09486 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPARCP09486 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPARCP09486 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPARCP09486 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPARCP09486 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPARCP09486 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPARCP09486 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPARCP09486 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPARCP09486 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPARCP09486 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPARCP09486 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPARCP09486 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPARCP09486 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPARCP09486 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPARCP09486 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPARCP09486 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPARCP09486 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPARCP09486 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPARCP09486 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPARCP09486 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPARCP09486 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPARCP09486 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPARCP09486 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPARCP09486 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPARCP09486 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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