Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYBBP04839 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CYBBP04839 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYBBP04839 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYBBP04839 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CYBBP04839 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYBBP04839 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYBBP04839 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYBBP04839 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CYBBP04839 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYBBP04839 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYBBP04839 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYBBP04839 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CYBBP04839 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYBBP04839 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYBBP04839 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYBBP04839 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CYBBP04839 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYBBP04839 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYBBP04839 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CYBBP04839 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYBBP04839 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYBBP04839 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CYBBP04839 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYBBP04839 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYBBP04839 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CYBBP04839 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYBBP04839 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYBBP04839 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYBBP04839 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CYBBP04839 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYBBP04839 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYBBP04839 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYBBP04839 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYBBP04839 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYBBP04839 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYBBP04839 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYBBP04839 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYBBP04839 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYBBP04839 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYBBP04839 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYBBP04839 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYBBP04839 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYBBP04839 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYBBP04839 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYBBP04839 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYBBP04839 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CYBBP04839 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYBBP04839 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYBBP04839 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYBBP04839 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYBBP04839 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CYBBP04839 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYBBP04839 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYBBP04839 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYBBP04839 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYBBP04839 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYBBP04839 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYBBP04839 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CYBBP04839 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYBBP04839 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYBBP04839 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYBBP04839 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYBBP04839 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms