Protein–RNA interactions for Protein: P00738

HP, Haptoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPP00738 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPP00738 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPP00738 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPP00738 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPP00738 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPP00738 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPP00738 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPP00738 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPP00738 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPP00738 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPP00738 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPP00738 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPP00738 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPP00738 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPP00738 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HPP00738 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPP00738 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPP00738 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPP00738 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPP00738 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPP00738 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPP00738 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPP00738 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPP00738 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPP00738 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPP00738 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPP00738 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPP00738 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPP00738 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPP00738 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPP00738 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPP00738 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPP00738 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPP00738 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPP00738 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HPP00738 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPP00738 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPP00738 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPP00738 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPP00738 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPP00738 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPP00738 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPP00738 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPP00738 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPP00738 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPP00738 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPP00738 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPP00738 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPP00738 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPP00738 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPP00738 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPP00738 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPP00738 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPP00738 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPP00738 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPP00738 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPP00738 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPP00738 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPP00738 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPP00738 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPP00738 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPP00738 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPP00738 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPP00738 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPP00738 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPP00738 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPP00738 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPP00738 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms